Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms