Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUX9

CHMP7, Charged multivesicular body protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP7Q8WUX9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHMP7Q8WUX9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHMP7Q8WUX9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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