Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC12Q8WUD4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC12Q8WUD4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms