Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms