Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ZNF548Q8NEK5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ZNF548Q8NEK5 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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