Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf163Q8N9P6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms