Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms