Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC84Q86UT8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms