Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms