Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AGAP9Q5VTM2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms