Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITRM1Q5JRX3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms