Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms