Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SP6Q3SY56 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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