Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 GPR79-201ENST00000498175 868 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC091153.4-201ENST00000570493 480 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 FAAP24-205ENST00000590281 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 OR5G5P-204ENST00000627642 621 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
KRTAP20-1Q3LI63 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms