Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC57Q2TAC2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC57Q2TAC2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms