Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC96Q2M329 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms