Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KNOP1Q1ED39 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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