Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IMPG1Q17R60 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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