Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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