Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CNGA3Q16281 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNGA3Q16281 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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