Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKIV2LQ15477 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms