Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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COL19A1Q14993 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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COL19A1Q14993 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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COL19A1Q14993 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms