Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM25Q14258 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms