Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IKBKEQ14164 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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