Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOFQ13790 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOFQ13790 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APOFQ13790 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APOFQ13790 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
APOFQ13790 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
APOFQ13790 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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