Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PMS2P11Q13670 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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