Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTCH1Q13635 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTCH1Q13635 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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