Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEUROD1Q13562 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
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