Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CAMK2BQ13554 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CAMK2BQ13554 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms