Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDAC1Q13547 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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