Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BFSP2Q13515 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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