Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AC015910.1-202ENST00000580264 633 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDAP1Q13442 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDAP1Q13442 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms