Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms