Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHAF1AQ13111 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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