Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX4Q12846 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX4Q12846 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX4Q12846 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX4Q12846 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX4Q12846 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
STX4Q12846 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
STX4Q12846 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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