Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGEF5Q12774 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms