Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC15Q0P6D6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms