Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ID3Q02535 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ID3Q02535 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms