Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK3Q00526 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms