Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HOXC5Q00444 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms