Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TFAMQ00059 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms