Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IRX1P78414 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms