Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRAMEP78395 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEP78395 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms