Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRA2BP62995 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms