Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms