Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P61574 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms