Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNAP25P60880 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms