Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNTAP49354 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FNTAP49354 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms