Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms