Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSR1P43307 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSR1P43307 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSR1P43307 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSR1P43307 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms